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作者：蘇艷佳吳微微郝宏蕾任文彥郁麗娟葉新斌單位：浙江省公安物證鑒定中心
成功率比較分析
在12775份樣本中有11658份檢材采用兩種試劑盒進行檢驗，分別得到15個(IdentifilerTM試劑盒)和8個(AGCUMini試劑盒)完整的STR基因座及性別位點數(shù)據(jù)，分型均獲成功;有625份檢材采用IdentifilerTM試劑盒未成功分型，而采用AGCUMini試劑盒分型成功，見圖2;其余492份檢材，采用兩種試劑盒均未獲成功分型。計算成功率IdentifilerTM試劑盒為91.3%;AGCUMini試劑盒為96.1%。隨機抽取兩種試劑盒均獲成功分型血樣中的10份，以及IdentifilerTM試劑盒未成功分型，而AGCUMini試劑盒分型成功血樣中的10份進行定量分析。
結(jié)果顯示模板DNA濃度前者在0.62～1.17ng/μL之間、后者在0.32～0.46ng/μL之間。說明AGCUMini體系對微量物證的STR分析能力優(yōu)于IdentifilerTM體系。對不同濃度梯度的模板DNA(9947A)進行分析，結(jié)果采用AGCUMini系統(tǒng)，10μL擴增體系中40pg模板DNA(9947A)可得到完整分型，其靈敏度高于IdentifilerTM試劑盒，而與MinifilerTM試劑盒相當。
遺傳學(xué)數(shù)據(jù)
AGCUMini系統(tǒng)包含的8個基因座中，D19S253基因座未見浙江人群中的遺傳學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)。本文對699份浙江漢族無關(guān)個體D19S253基因座多態(tài)性進行了調(diào)查。結(jié)果該基因座共檢出9個等位基因，37個基因型，分布經(jīng)χ2檢驗符合Hardy-Weinberg平衡定律(P＞0.05)，其基因頻率見表1。D19S253基因座雜合度(H)為0.8140、匹配概率(Pm)為0.0690、個體識別力(DP)為0.9130、非父排除率(PE)為0.6250、多態(tài)性信息含量(PIC)為0.7729，屬高鑒別力的遺傳標記(DP＞0.9，H＞0.7)，適于在浙江漢族人群的法醫(yī)學(xué)個體識別和親權(quán)鑒定中選用。
討論
AGCUMini系統(tǒng)采用MiniSTR技術(shù)，通過對引物序列的改進，減短了擴增產(chǎn)物長度，有利于對降解及微量DNA的分型檢驗。本文結(jié)果也顯示，以相同量的模板DNA，AGCUMini系統(tǒng)對降解及微量DNA的檢驗成功率更高。但由于擴增產(chǎn)物片段短，等位基因片段長度范圍相互重疊的幾率比STR高，因此復(fù)合擴增的基因座數(shù)目有限，和商品化STR試劑盒相比較，要想達到同樣的個人識別力，必須增加復(fù)合擴增的次數(shù)。而AGCUMini系統(tǒng)聯(lián)合應(yīng)用其它相關(guān)STR試劑盒，可有效提高識別能力。
本文聯(lián)合AGCUMini和IdentifilerTM試劑盒，通過分型檢測，應(yīng)用乘積法則進行計算，結(jié)果顯示單獨和聯(lián)合使用上述兩種試劑盒的累積個體識別能力分別為1～3.5×10－11、1～1.7×10－17、1～1.4×10－24，累計非父排除概率分別為0.9999、0.9999984、0.9999999975，能力明顯提高。此外，根據(jù)文獻，三聯(lián)體親子鑒定至少應(yīng)檢驗15個PE≥0.5741的基因座。而聯(lián)合應(yīng)用IdentifilerTM和AGCUMini體系后，基因座數(shù)量可達20個，其中PE值滿足要求的有15個，可以滿足三聯(lián)體親子鑒定的要求。
AGCUMini系統(tǒng)包含的STR基因座中除D19S253外，其余7個均包含在常見商業(yè)化試劑盒中，這使該系統(tǒng)具備良好的數(shù)據(jù)兼容性，其分型結(jié)果可直接與現(xiàn)有的數(shù)據(jù)進行檢索和比對。在全國“打拐”DNA數(shù)據(jù)庫建庫中，本實驗室檢驗的樣本中有2名被拐兒童樣本分別比中2對被拐兒童父母。聯(lián)合應(yīng)用IdentifilerTM和AGCUMini系統(tǒng)，計算累計父權(quán)指數(shù)為2.76×1011和1.48×1014，從而作出在遺傳學(xué)角度確信親子關(guān)系的結(jié)論。